Además de los Gobiernos locales y Regionales, en los departamentos donde se transfiere canon minero, las universidades nacionales también se ven beneficiadas con este recurso, Para el 2008 fueron transferidos S/. 221.1 mill. a las universidades en los departamentos donde reciben canon minero, de este monto, la Universidad Nacional Jorge Basadre Grohmann ha recibido S/. 35.6 millones. En los últimos 5 años se han transferido S/. 98.9 millones de soles; siendo la Universidad que ha recibido mayor canon Minero a nivel Nacional, según informe de MIM-Tacna ( Mejorando la Inversión Municipal).
Las universidades nacionales de Ancash para el 2008 recibieron S/. 66 millones, este monto de acuerdo a la ley del canon Minero será distribuido en partes iguales, a cada universidad, universidad de Santa y la universidad Santiago Antúnez de Mayolo, le correspondería S/. 33 mill. Siendo las segundas universidades con mayor canon a nivel nacional.
En los 5 últimos años la universidad Jorge Basadre ha Gastado S/. millones de acuerdo a la información de portal de Transparencia del Ministerio de Economía y Finanzas, en el 2008 sólo se ha gastado 1.5 millones y el proyecto con mayor monto de ejecución es el de Implementación de los Laboratorios de la Facultad de Metalurgia con S/. 983,588 soles.
El monto que reciben las universidades es el 20% del total que reciben los gobiernos regionales por Canon Minero y según la legislación vigente indica que es destinado exclusivamente a la inversión en investigación científica y tecnológica que potencien el desarrollo regional.